Muỗi ăn các loại thức ăn khác nhau tùy thuộc vào giới tính và giai đoạn sống. Ấu trùng muỗi sống trong các vũng nước đọng và chủ yếu tiêu thụ tảo và các sinh vật thủy sinh cực nhỏ. Khi chúng thành nhộng, muỗi sẽ ngừng kiếm ăn cho đến khi quá trình biến thái xảy ra và chúng trở thành con trưởng thành. Con cái trưởng thành chủ yếu ăn máu của các động vật khác, trong khi con đực ăn mật hoa.
Tất cả các loài muỗi đều có một số điểm giống nhau, chẳng hạn như cần phải thả trứng vào nước, nhưng sự khác biệt lớn tồn tại trong thói quen của hơn 2.500 loài muỗi sống trên toàn thế giới. Ví dụ, các loài khác nhau thích các loại môi trường nước khác nhau để lắng đọng trứng; một số thích bãi triều, trong khi những người khác thích đầm lầy. Một số loài, chẳng hạn như những loài thuộc giống Culex và Aedes, thường xuyên ăn máu của con người. Tuy nhiên, muỗi Aedes thường không xâm nhập vào nơi ở để ăn thịt người, trong khi muỗi Culex thường xuyên làm như vậy.
Muỗi thuộc giống Anopheles đặc biệt đáng chú ý đối với con người: Những con muỗi này có thể mang và truyền bệnh sốt rét do một loại ký sinh trùng nhỏ sống bên trong máu người gây ra. Khi muỗi đốt người bị nhiễm bệnh, một số ký sinh trùng có thể đi vào dạ dày của côn trùng. Sau đó, khi muỗi đốt người khác, một số ký sinh trùng có thể xâm nhập vào dòng máu của người thứ hai.
