Một số dạng địa hình chính được tìm thấy ở Honduras bao gồm cao nguyên nội địa rộng lớn với đồi và núi, vùng đất thấp Thái Bình Dương và Vùng đất thấp Caribe. Khí hậu thay đổi từ ôn đới trên núi đến nhiệt đới ở vùng đất thấp. Một hệ thống sông rộng lớn cắt ngang dãy núi Sierra Madre, các ngọn đồi bên trong và các thung lũng rộng lớn màu mỡ được tìm thấy ở vùng này.
Vùng đất thấp Caribe được bao phủ bởi những bãi biển đầy cát và trải dài trên đường bờ biển phía bắc. Vùng này có Bờ biển Muỗi, một khu vực không có người ở gồm rừng rậm, đầm phá và đầm lầy ngập mặn. Các vùng đất thấp ở Thái Bình Dương có kích thước nhỏ hơn đáng kể và bao quanh Vịnh Fonesca, nơi có thể tìm thấy một số đảo núi lửa không hoạt động. Vùng đất thấp này trở thành đầm lầy gần bờ biển. Nhìn chung, Honduras là một quốc gia giàu nước, với thủy điện được coi là một trong những nguồn tài nguyên thiên nhiên của nó. Chỉ có một hồ quan trọng có tên là Hồ Yojoa, nhưng có rất nhiều con sông quan trọng.
Vùng nội địa miền núi là nơi sinh sống của hầu hết dân số Honduras và chiếm 80% tổng diện tích của nó. Nhiều thung lũng có sàn bằng phẳng được tìm thấy ở đây với các làng mạc, thị trấn và thủ đô của đất nước, Tegucigalpa, nằm trên những thung lũng lớn hơn. Đất đai ở vùng này đa phần là khó qua lại và không thích hợp cho việc canh tác vì địa hình hiểm trở. Chất lượng đất cũng kém. Một áp thấp thuận tiện và nổi bật chạy dọc khắp đất nước qua vùng cao nguyên và cung cấp một tuyến đường giao thông tương đối dễ dàng giữa các bờ biển phía Bắc và phía Nam.
