Sau khi gặp Jill Rhodes vào năm 1992, Sean Hannity đã kết hôn với cô vào năm 1993, bất chấp sự phản đối từ mục sư của họ và đồng nghiệp của cô. Cặp đôi đã có với nhau hai mặt con vào năm 2015.
Năm 1992, Hannity làm việc tại Huntsville, Alabama, nơi anh có chương trình radio buổi chiều của riêng mình. Anh ta đã thiết lập một cuộc tranh luận thị trưởng trong thành phố, nơi anh ta gặp Rhodes, một nhà văn của The Huntsville Times. Hai người hẹn hò trong ba tháng, và khi Hannity chấp nhận lời đề nghị tham gia một chương trình radio ở Atlanta, Georgia, anh đã đề nghị cô chuyển đến sống cùng anh. Cô ấy đồng ý với điều kiện là họ phải kết hôn.
Hannity đã tranh cãi chính trị với mục sư của cặp đôi trong buổi tư vấn tiền hôn nhân khi Hannity nói với mục sư rằng nhà thờ đã trở nên quá tự do và mục sư nói với Rhodes rằng cô ấy thật điên rồ khi kết hôn với Hannity. Các đồng nghiệp của cô tại tòa báo cũng khuyên cô không nên kết hôn với anh ta, vì công việc của anh ta là một người dẫn chương trình phát thanh. Mặc dù vậy, cặp đôi đã kết hôn vào ngày 9 tháng 1 năm 1993. Hannity đã tuyên bố rằng mục sư cũng đã kết hôn với nhiều người bạn của cặp đôi, nhưng Hannity và Rhodes là cặp vợ chồng duy nhất vẫn còn kết hôn.
Hai vợ chồng có một bé trai và một bé gái. Con trai của họ, Patrick, sinh năm 2005. Con gái của họ, Merri Kelly, sinh năm 2008.
