Tim bò sát, phần lớn tương tự như tim lưỡng cư, có ba ngăn và cung cấp sự phân tách vừa phải giữa máu được oxy hóa và khử oxy với hai tâm nhĩ của chúng, một tâm nhĩ nhận máu oxy hóa và một tâm nhĩ nhận máu khử oxy từ phổi. Tâm thất của tim bò sát vẫn cho phép máu được oxy hóa và khử oxy xen kẽ với nhau, có nghĩa là nó không mạnh mẽ hoặc hiệu quả như tim của động vật có vú.
Tách máu xảy ra do máu đến được hẹn giờ độc lập qua tâm nhĩ. Nếu máu đến đồng thời qua cả hai tâm nhĩ thì sự trộn lẫn sẽ xảy ra, nhưng điều này có thể ở mức độ lớn hơn hoặc ít hơn tùy thuộc vào nhiệt độ cơ thể và trạng thái hoạt động của con vật.
Khi máu đến ống động mạch, máu sẽ được rút xuống ba kênh của ống động mạch thân, lối vào hệ tuần hoàn, rồi tiếp tục di chuyển qua phần còn lại của cơ thể bò sát. Sự tắc nghẽn dẫn đến ba hệ thống riêng biệt, hệ thống thân phổi và hệ thống thân trái và phải.
Tim của động vật có vú hướng đến hoạt động liên tục và mức độ vận động và gắng sức cao trong khi tim của bò sát hoạt động tốt hơn trong các đợt nổ ngắn và yêu cầu con vật phải nghỉ ngơi thường xuyên và làm việc để kiểm soát nhiệt độ cơ thể. Nồng độ oxy trong máu thấp hơn khiến loài bò sát chậm chạp và dễ ngủ.
