Uniqlo được thành lập tại Hiroshima, Nhật Bản vào năm 1984. Nó bắt đầu là một cửa hàng quần áo bình thường và tên của nó là viết tắt của "Unique Clothing Warehouse". Uniqlo được thành lập như một phần của công ty Fast Retailing và được tách ra thành công ty con thuộc sở hữu hoàn toàn của Fast Retailing trước khi mở rộng ra quốc tế.
Công ty mẹ của Uniqlo, Fast Retailing, được gọi là Ogori Shoji cho đến năm 1991. Ogori Shoji được thành lập vào năm 1949 tại Yamaguchi, Nhật Bản. Trước khi thành lập Uniqlo, Ogori Shoji đã bán quần áo nam thông qua chuỗi cửa hàng Men's Shop OS. Uniqlo là cửa hàng quần áo unisex đầu tiên của công ty.
Cửa hàng được thành lập để cung cấp quần áo phù hợp với mọi phong cách. Các thiết kế của Uniqlo hướng đến sự đơn giản để khách hàng có thể điều chỉnh chúng cho phù hợp với phong cách và tủ quần áo hiện có. Các sản phẩm của Uniqlo nhằm không phụ thuộc vào xu hướng thời trang và sự khác biệt về phong cách giữa các nhóm tuổi, giới tính và khu vực.
Uniqlo lần đầu tiên mở rộng ra bên ngoài Nhật Bản vào năm 2002. Các cửa hàng quốc tế ban đầu ở Trung Quốc và Vương quốc Anh. Công ty đã mở rộng sang Hoa Kỳ, Hồng Kông và Hàn Quốc vào năm 2005, và đến Malaysia vào năm 2010. Các địa điểm của Uniqlo cũng đã được mở ở Úc, Bangladesh, Pháp, Ma Cao và Indonesia cũng như ở Philippines, Nga, Singapore, Đài Loan và Thái Lan.