Bảo vệ bản thân khỏi vi rút Ebola có thể đơn giản như tránh xa các khu vực đang bùng phát dịch bệnh. Đối với những người không có tùy chọn này, cần hết sức cẩn thận để tránh tiếp xúc với nước bọt, máu, nước tiểu, phân, chất nôn, chất nhầy, sữa mẹ, tinh trùng và các chất dịch cơ thể khác của người bị nhiễm bệnh.
Vi rút Ebola truyền từ động vật bị nhiễm bệnh sang người và sau đó truyền từ người sang người thông qua tiếp xúc với chất dịch cơ thể của người bị nhiễm bệnh, vì vậy cần phải luôn có biện pháp phòng ngừa thích hợp khi ở gần người đã bị nhiễm vi rút Ebola vi-rút. Có thể cần phải thực hiện tốt các biện pháp phòng ngừa sau khi người bị nhiễm bệnh hồi phục, vì vi-rút có thể hoạt động trong chất dịch cơ thể của họ trong nhiều tháng sau khi họ ngừng biểu hiện các triệu chứng của bệnh.
Vì bệnh do vi rút Ebola không lây truyền qua đường không khí, nên về mặt lý thuyết, những người khỏe mạnh có thể tránh lây nhiễm ngay cả khi tiếp xúc trực tiếp với bệnh nhân bị nhiễm bệnh. Nhân viên y tế đang chăm sóc những người bị nhiễm Ebola có nguy cơ lây nhiễm vi rút đặc biệt. Nguy cơ lây truyền sẽ tăng lên khi không tuân thủ quy trình vệ sinh phù hợp.
Những người ở gần người đã bị nhiễm Ebola tuyệt đối không được tiếp xúc với chất dịch cơ thể của người bệnh và nên chú ý bảo vệ màng nhầy của họ.