Theo Phòng thí nghiệm chất lỏng pháp y, xét nghiệm ma túy bằng tăm bông qua miệng nhạy cảm hơn tới 60% với cocaine, opiates và methamphetamine so với xét nghiệm tức thì dựa trên nước tiểu. Điều này làm giảm đáng kể số lượng kết quả âm tính giả. Phòng thí nghiệm chất lỏng pháp y trích dẫn một nghiên cứu từ Tạp chí Chất độc phân tích, chứng minh rằng xét nghiệm nước tiểu cho kết quả âm tính giả gấp đôi so với xét nghiệm ngoáy miệng.
Một điểm khác biệt chính giữa hai loại xét nghiệm liên quan đến việc phát hiện THC, hóa chất hoạt động trong cần sa. Phòng thí nghiệm chất lỏng pháp y báo cáo rằng miếng gạc miệng có khả năng phát hiện việc sử dụng thuốc lên đến 72 giờ sau khi thuốc được sử dụng. Ngược lại, xét nghiệm nước tiểu thường phát hiện THC trong các mẫu lên đến 120 giờ sau khi thuốc được sử dụng. MedicalHealthTests.com cho biết thêm rằng hiệu quả của các xét nghiệm có thể rất khác nhau, vì không có chứng nhận hoặc các giao thức nhất quán để hướng dẫn quy trình xét nghiệm.
MedicalHealthTests.com giải thích rằng việc đánh răng, dùng chỉ nha khoa và thực hành vệ sinh răng miệng có thể khiến xét nghiệm ngoáy miệng tạo ra âm tính giả. Một nghiên cứu năm 2006, được công bố trên tạp chí Clinical Biochemist Reviews, cho thấy uống rượu ngay sau khi uống cần sa sẽ tạm thời súc miệng và tạo ra âm tính giả. Các tác giả của nghiên cứu cho rằng nước có thể có tác dụng tương tự. Các tác giả chỉ ra rằng thử nghiệm từ 15 đến 20 phút sau khi rửa sạch sẽ cho kết quả chính xác hơn.