Các phân loài khác nhau của kỳ nhông và sa giông thở khác nhau ở các giai đoạn khác nhau của cuộc đời. Kỳ giông siren sử dụng mang để thở trong suốt cuộc đời của chúng, trong khi kỳ nhông hổ chỉ sử dụng mang khi còn nhỏ và sau đó phát triển khả năng thở bằng phổi đã phát triển của chúng. Hầu hết kỳ nhông đều thở bằng da và màng trong miệng và cổ họng, vì chúng không có mang hoặc phổi để thở.
Một lý do mà các loại kỳ nhông khác nhau thở khác nhau là do nhiều loài kỳ nhông khác nhau sống trong các môi trường khác nhau. Ví dụ, kỳ giông còi báo động phải có khả năng thở dưới nước, điều này giải thích việc sử dụng mang trong suốt thời gian tồn tại của nó. Kỳ nhông hổ mất mang khi trưởng thành, khiến nó cần có khả năng thở bằng phổi.
Phần lớn kỳ nhông thở bằng sự kết hợp của da và màng trong miệng và cổ họng. Những con kỳ nhông không phổi này, cũng như những loài kỳ nhông khác, phải có làn da ẩm để có thể tồn tại. Kỳ nhông có thể chết nếu da của chúng quá khô hoặc quá nóng. Trong khi một số loài kỳ nhông dành cả đời dưới nước để duy trì làn da ẩm ướt, chẳng hạn như kỳ nhông mang như kỳ nhông còi báo động, thì các loài kỳ nhông khác lại tìm đến cách tránh nắng bằng cách ẩn mình dưới những tảng đá hoặc thỉnh thoảng nhúng vào những vũng nước nhỏ. Một số loài kỳ nhông đã quá quen với việc sống trong không gian ẩm ướt, tối tăm nên chúng bị giảm kích thước mắt và da nhợt nhạt.
