Melanin
Ngoài màu mắt của trẻ, melanin có nhiệm vụ quyết định màu tóc và da. Khi một đứa trẻ được sinh ra, cơ thể của trẻ bắt đầu sản xuất melanin, được tiết ra bởi các tế bào đặc biệt gọi là tế bào hắc tố. Các tế bào hắc tố tiết ra càng nhiều hắc tố, mắt của trẻ sẽ càng sẫm màu. Nếu các tế bào hắc tố chỉ tiết ra một lượng nhỏ melanin, mắt của trẻ sẽ có màu nhạt như xanh lam hoặc màu hạt dẻ. Một em bé có tế bào hắc tố tiết ra lượng melanin cao hơn sẽ có đôi mắt sẫm màu hơn như màu nâu. Bất kể lượng melanin được tiết ra như thế nào, các tế bào hắc tố hoạt động mạnh nhất trong chín tháng đầu đời của trẻ, đó là lý do tại sao mắt thay đổi màu nhanh nhất trong thời gian đó. Bởi vì màu mắt được mã hóa trong gen của em bé, nó không thể bị thay đổi bởi các yếu tố bên ngoài. Ví dụ, cha mẹ không thể làm cho mắt của con họ sáng hơn hoặc tối hơn bằng cách kiểm soát việc trẻ tiếp xúc với ánh sáng. Mặc dù chế độ ăn uống có thể giúp ích cho sức khỏe mắt của trẻ, nhưng thực phẩm mà trẻ ăn cũng không ảnh hưởng đến màu mắt.
Di truyền
Gen là yếu tố quyết định cuối cùng của màu mắt và việc xác định màu mắt có thể phức tạp. Khả năng một đứa trẻ có đôi mắt với một màu nhất định bị ảnh hưởng phần lớn bởi màu mắt của cha mẹ, nhưng màu mắt cũng có thể được xác định thông qua các gen lặn. Ví dụ, nếu cả bố và mẹ đều có mắt nâu, thì khả năng cao là con của họ cũng sẽ có mắt nâu. Nhưng nếu có mã hóa di truyền trong dòng dõi của cha mẹ để có mắt xanh lục hoặc xanh lam, thì những gen đó có thể được truyền sang con và người đó có thể có đôi mắt sáng hơn. Nếu bố hoặc mẹ của một bên mắt nâu có mắt xanh, thì khả năng cao hơn một chút là con cũng sẽ có mắt xanh. Nếu một bên cha hoặc mẹ có đôi mắt nâu và người kia có đôi mắt xanh lam, thì có khoảng 50-50 khả năng đứa trẻ kết thúc với một trong hai màu mắt đó.
Bất thường
Thay đổi màu mắt là bình thường ở trẻ sơ sinh, nhưng cha mẹ nên để ý các dấu hiệu bất thường khác và các vấn đề về mắt. Cha mẹ nên đưa trẻ đến bác sĩ nhi khoa nếu nhận thấy chỉ một bên mắt thay đổi màu sắc, điều này có thể cho thấy có vấn đề về di truyền. Ví dụ, một đứa trẻ có một mắt nâu và một mắt xanh có thể mắc hội chứng Waardenburg, một chứng rối loạn di truyền hiếm gặp. Độ mờ của mắt cũng là bất thường và cần được đánh giá chuyên môn.