Trong nghiên cứu Phật giáo, hoa sen tượng trưng cho sự tái sinh và tượng trưng cho sự thuần khiết. Hoa sen cũng tượng trưng cho sự sống còn, vì hoa không bị ảnh hưởng bởi nước đục và nước đục mà nó nở hoa.
Hoa sen trắng tượng trưng cho tâm hồn và tinh thần trong sáng, còn hoa sen đỏ tượng trưng cho niềm đam mê. Hoa sen xanh tượng trưng cho lòng thủy chung. Hoa sen hồng đại diện cho lịch sử của Phật giáo và giáo lý của nó. Hoa sen vàng biểu thị mức độ giác ngộ và thành tựu cao nhất.
Bùn trong đó hoa sen nở ra tượng trưng cho sự đau khổ của con người. Các Phật tử tin rằng đau khổ là một phần của kế hoạch vĩ đại để làm cho con người mạnh mẽ hơn. Khi hoa sen lớn lên trong bùn và âm u, điều này tượng trưng cho con người vượt lên trên những tai ương trần thế để đạt đến trạng thái giác ngộ.