Người Nhện thường được cho là không có điểm yếu cụ thể nào, hoặc ít nhất là không có điểm yếu nào không thể thiếu trong cốt truyện vì điểm yếu của Siêu nhân đối với Kryptonite. Theo hồ sơ nhân vật Marvel của anh ấy, Spider- Ý thức về người nhện và khả năng thể chất siêu phàm của con người khiến anh ta hầu như không bị tổn hại.
Tuy nhiên, hồ sơ nhân vật của Người Nhện cũng nói rằng anh ta có thể tự phá hoại bản thân bằng cách ghi đè nhận thức những phản xạ tự chủ này. Nói cách khác, thiếu niềm tin vào bản năng của chính mình sẽ thể hiện một điểm yếu nghiêm trọng.
Sự phụ thuộc vào bản năng của anh ấy cũng có thể được coi là một điểm yếu. Ví dụ, khi cảm lạnh thông thường làm suy yếu giác quan người nhện của anh ta trong "The Amazing Spider-Man # 39" (1966), Green Goblin đã giành được lợi thế khác biệt so với anh ta.
Giống như nhiều siêu anh hùng khác, Người Nhện cũng dễ bị ảnh hưởng bởi điện cũng như mối quan hệ gia đình hoặc cá nhân, chẳng hạn như sức khỏe của dì May.