Chihuahua lông ngắn hiện đại có nguồn gốc ở Chihuahua, Mexico, vào những năm 1850. Nguồn gốc cổ xưa của giống chó này còn bị tranh cãi, nhưng các nhà sử học tin rằng Chihuahua lần đầu tiên được phát hiện ở Mexico, Trung Mỹ hoặc Nam Mỹ.
Một giả thuyết cho rằng Chihuahua là hậu duệ của giống chó Techichi Nam Mỹ, được miêu tả trong các bức chạm khắc của Toltec từ thế kỷ thứ chín. Hình minh họa của Techichis miêu tả các đặc điểm tương tự như Chihuahua, bao gồm đầu tròn và đôi tai to của chúng. Dân số Techichi đã được đồng hóa vào văn hóa Aztec sau khi người Toltec bị chinh phục, nhưng nó dần dần bị thu hẹp trong cuộc chinh phục của người Tây Ban Nha. Người Aztec tin rằng chó Techichi là người có khả năng thấu thị những người dẫn đường cho thế giới ngầm và ca ngợi chúng là biểu tượng của sự thần bí và chữa bệnh.