Một số vấn đề với hoạt động săn bắt cá voi bao gồm khả năng tuyệt chủng của một số loài, việc thiếu phương pháp nhân đạo để săn cá voi trên biển và nhu cầu giảm về thịt và sản phẩm của cá voi. Năm 1986, International Ủy ban đánh bắt cá voi đã ban hành lệnh cấm đánh bắt cá voi thương mại, nhưng Nhật Bản, Iceland và Na Uy vẫn tiếp tục đánh bắt cá voi vì những sơ hở trong lệnh cấm.
Lệnh cấm được đưa ra sau khi có thông tin rõ ràng rằng việc săn bắt cá voi đang khiến quần thể cá voi gặp nguy hiểm. Một hoạt động không bền vững do các loài động vật sống lâu và sinh sản chậm, săn bắt cá voi đã làm giảm số lượng nhiều loài xuống một phần nhỏ so với mức trước đây của chúng.
Cũng không thể giết một con cá voi một cách nhân đạo trên biển. Cá voi là mục tiêu di chuyển bị bắn vào từ những con tàu di chuyển dọc theo bề mặt đại dương thường xuyên sóng gió. Ngoài ra, các phương pháp dùng để giết cá voi, chẳng hạn như dùng súng bắn lựu đạn, có thể dẫn đến cái chết từ từ và đau đớn cho con vật.
Một vấn đề khác là nhu cầu đối với các sản phẩm và thịt từ cá voi đang giảm. Ở nhiều nơi, nhu cầu về thịt không cao để tiêu thụ những gì được săn bắt. Do đó, thịt cá voi được giữ trong các kho dự trữ đông lạnh lớn. Các khoản trợ cấp của chính phủ giúp những người đánh bắt cá voi tiếp tục kinh doanh trong những trường hợp không đủ cầu cho sản phẩm của họ.
