Theo Văn phòng Thuốc bổ sung Chế độ ăn uống của Viện Y tế Quốc gia, các tác dụng phụ do tiêu thụ canxi dư thừa dưới dạng thực phẩm chức năng hoặc thuốc viên kháng axit bao gồm tăng canxi huyết (mức canxi tăng cao trong máu), canxi lắng đọng trong mô mềm, táo bón và sỏi thận. Đôi khi, tăng calci huyết có thể dẫn đến rối loạn tâm thần.
Hai tác dụng phụ phổ biến nhất của việc thừa canxi là táo bón và sỏi thận. Mặc dù canxi rất cần thiết cho sự co cơ bình thường, nhưng lượng canxi dư thừa sẽ cản trở các làn sóng nhịp nhàng của nhu động ruột, dẫn đến táo bón.Mặc dù táo bón có thể gây khó chịu, nhưng sỏi thận, do canxi dư thừa hình thành, lại gây ra những cơn đau dữ dội. Trong máu, canxi di chuyển dưới dạng các ion tích điện dương. Máu cũng chứa phốt phát, tồn tại dưới dạng các ion mang điện tích âm. Ở nồng độ bình thường, hai loại ion này vẫn ở trong dung dịch, và thận bài tiết canxi và /hoặc phốt phát dư thừa để duy trì mức bình thường của cả hai ion. Tuy nhiên, khi một lượng lớn canxi đi vào máu, khả năng duy trì sự cân bằng này của thận sẽ trở nên quá tải. Các ion canxi dư thừa liên kết với bất kỳ phốt phát nào mà chúng gặp, và canxi phốt phát kết tủa ra khỏi dung dịch, tạo thành sỏi thận. Mặc dù những viên sỏi nhỏ có thể đi vào nước tiểu mà không được chú ý, nhưng những viên sỏi lớn hơn sẽ bị mắc kẹt trong thận, niệu quản hoặc bàng quang, gây đau và chảy máu dữ dội.
