Loài bò sát hít thở giống như con người, hít vào và thở ra bằng phổi của chúng. Một số loài bò sát có thể hỗ trợ hô hấp thông qua các phương tiện khác nhau, chẳng hạn như da thấm để trao đổi khí ở thủy sinh rùa, nhưng tất cả các loài bò sát đều phải thở bằng phổi để tồn tại.
Mặc dù phổi là cần thiết cho tất cả các loài bò sát, nhưng cách không khí vào và ra khỏi phổi khác nhau tùy theo loài. Một số loài di chuyển không khí vào và ra khỏi phổi bằng hệ cơ dọc trục, trong khi những loài khác sử dụng bơm hút khí để có thể chạy quãng đường dài mà không cần dừng lại để thở. Cá sấu là loài bò sát có cách thở gần giống với con người.
