Các quốc gia không có cờ hình chữ nhật là Nepal, Thụy Sĩ và Thành phố Vatican. Những lá cờ này là hình vuông, cứu Nepal. Nó là một pennon đôi, hoặc một lá cờ có hình dạng của hai hình tam giác.
Quốc kỳ Nepal có màu đỏ tươi, tượng trưng cho màu của hoa đỗ quyên, quốc hoa. Màu sắc cũng đại diện cho sự kiên cường của người dân Nepal. Bút trên cùng hiển thị mặt trăng lưỡi liềm và đỉnh dưới hiển thị mặt trời. Đường viền của lá cờ có màu xanh lam tượng trưng cho hòa bình. Một số người cũng tin rằng hai bút chì tượng trưng cho hai tôn giáo lớn của đất nước, đó là Ấn Độ giáo và Phật giáo. Chúng cũng có thể đại diện cho các đỉnh của dãy Himalaya, nơi tọa lạc của Nepal.
Quốc kỳ của Thụy Sĩ có hình vuông và có hình chữ thập trắng trên nền đỏ. Nó tượng trưng cho danh dự, tự do và lòng chung thủy. Nó là quốc kỳ từ năm 1889 và được mô phỏng theo cờ của Schwyz, một trong những bang lâu đời nhất của đất nước.
Thành phố Vatican là một trong những quốc gia nhỏ nhất trên thế giới và được cai trị bởi Giáo hoàng. Quốc kỳ hình vuông của nó được thông qua vào năm 1929 và có một nửa màu vàng tươi và một nửa màu trắng. Một nửa màu vàng để trống, nhưng một nửa màu trắng chứa những chiếc chìa khóa bằng vàng và bạc của Thánh Peter và vương miện của Giáo hoàng.