Mayo Clinic giải thích rằng một số nguyên nhân gây ra tình trạng đi tiêu không kiểm soát được là tiêu chảy, táo bón, phẫu thuật và giảm khả năng lưu trữ của trực tràng. Các nguyên nhân tiềm ẩn khác là tổn thương dây thần kinh, tổn thương cơ, sa trực tràng hoặc sa trực tràng, tình trạng trực tràng của phụ nữ nhô ra qua âm đạo.
Mayo Clinic lưu ý: Tiêu chảy có thể khiến tình trạng đi tiêu không kiểm soát trở nên tồi tệ hơn vì khó giữ phân lỏng hơn trong trực tràng. Trong khi đó, những người bị táo bón mãn tính có thể mắc chứng đại tiện không tự chủ vì phân bị va đập quá lớn để đi qua trực tràng có thể khiến trực tràng và cơ ruột căng ra và phát triển yếu hơn theo thời gian. Các cơ bị tổn thương này tạo điều kiện cho phân nhiều nước di chuyển xung quanh khối phân bị va đập, sau đó rò rỉ ra ngoài trực tràng. Rặn liên tục do táo bón cũng có thể dẫn đến tổn thương dây thần kinh, góp phần gây khó khăn trong việc kiểm soát nhu động ruột.
Theo Mayo Clinic, các nguyên nhân tiềm ẩn khác của tổn thương dây thần kinh dẫn đến không kiểm soát phân là đột quỵ, sinh con, tiểu đường, chấn thương tủy sống và bệnh đa xơ cứng. Các dây thần kinh bị ảnh hưởng có thể là dây thần kinh kiểm soát cơ vòng hậu môn hoặc những dây chịu trách nhiệm cảm nhận chất phân trong trực tràng. Sinh con cũng có thể dẫn đến chấn thương các vòng cơ của cơ thắt hậu môn, đây là một lý do tiềm ẩn khác dẫn đến tình trạng không kiểm soát được ruột. Loại tổn thương cơ này đặc biệt xảy ra ở những phụ nữ trải qua các thủ thuật cắt tầng sinh môn hoặc sinh con có sử dụng kẹp.