Cá sấu con thích nghi với môi trường sống bằng cách dựa vào lớp da ngụy trang, vị trí của mắt và lỗ mũi, khả năng khép tai và các cơ quan chuyên biệt của nó. Cả phổi và tim của cá sấu đều thích nghi với thời gian dài chìm trong nước.
Một trong những khả năng thích nghi của cá sấu đối với môi trường nằm ở phổi và tim chuyên biệt giúp chúng có thể ngập trong nước một cách an toàn. Phổi được bảo vệ bởi một cấu trúc ngăn không cho nước xâm nhập vào phổi ngay cả khi miệng đang mở. Trái tim có thể phân tách máu oxy và khử oxy và đưa máu giàu oxy đến não để cá sấu có thể ở dưới nước trong thời gian dài.
Mắt, mũi và tai của cá sấu cũng thích nghi với môi trường nhiều nước. Cả lỗ mũi và mắt của nó đều nằm trên đỉnh đầu để nó có thể chìm gần như hoàn toàn và vẫn thở bằng lỗ mũi. Khi mắt ngập nước, một lớp màng bảo vệ chúng và giúp cá sấu có thể nhìn thấy.
Một cách thích nghi khác là da cá sấu. Màu xám cùng các núm và bướu trên cơ thể cho phép nó hòa nhập với môi trường xung quanh, khiến cá sấu chúa trông giống như một khúc gỗ và cho phép nó rình mồi.
