Nhiều ký sinh trùng ảnh hưởng đến động vật trang trại và vật nuôi, và chúng có thể là giống bên trong và bên ngoài. Trong số các loài nội, Meat and Livestock Australia liệt kê nhiều loại giun, động vật nguyên sinh và sán là những loài ký sinh xâm lấn. Các loài bên ngoài, được gọi là ngoại ký sinh, bao gồm ruồi, ve và rận.
Theo Hobby Farms, mục tiêu và vòng đời của mỗi ký sinh trùng có thể khác nhau. Ví dụ, sán lá gan luôn bắt đầu vòng đời ở động vật nhai lại, chẳng hạn như bò, trước khi thải ra ngoài và lây nhiễm sang ốc sên để kết thúc vòng đời của nó. Ngoài ra, sâu cắt tóc sẽ lây nhiễm cho dê và cừu trước khi tìm kiếm vật chủ là người. Kích thước của ký sinh trùng cũng có thể thay đổi rất nhiều. Động vật nguyên sinh có kích thước siêu nhỏ, trong khi giun băng có thể đạt chiều dài lên tới 20 feet. Nhiều loài ngoại ký sinh có thể được đưa vào môi trường của động vật trang trại với số lượng lớn hơn do điều kiện thời tiết nhất định. Ví dụ, lũ lụt hoặc mưa lớn có thể gây ra sự gia tăng các quần thể côn trùng cắn, đặc biệt là các loại ruồi, muỗi vằn và muỗi. Bọ ve cũng có thể trở nên phổ biến hơn. Tác động của ký sinh trùng đối với động vật trang trại và vật nuôi có thể từ khó chịu đến cực kỳ nguy hiểm. Tùy thuộc vào loài và vật chủ, sự xâm nhập của ký sinh trùng có thể dẫn đến các tình huống suy nhược và chết người như mất máu nghiêm trọng, giảm cảm giác thèm ăn và tiêu chảy. Ký sinh trùng cũng có thể hoạt động như vật trung gian truyền bệnh, khiến vật nuôi dễ bị nhiễm bệnh hơn. Các loài bên ngoài như bọ ve, ruồi và rận, có thể làm gián đoạn hành vi chăn thả và tạo vết loét hở trên động vật. Cuối cùng, sự lây nhiễm không được điều trị có thể làm cho động vật chậm phát triển và sinh sản, gây hại cho quá trình tiết sữa và làm hỏng chất lượng của bọ chét.
