Có thể đưa các bài hát vào iPod mà không cần iTunes bằng cách sử dụng phần mềm khác cho phép chuyển nhạc từ máy tính sang thiết bị. Có các lựa chọn thay thế cho iTunes dành cho Windows, Linux, và hệ thống OSX.
Có các tùy chọn phần mềm của bên thứ ba dành cho chủ sở hữu iPod muốn chuyển nhạc sang thiết bị của họ mà không cần sử dụng iTunes. Các tùy chọn này yêu cầu người dùng tải phần mềm về máy tính của họ. Cắm iPod và kích hoạt phần mềm đã cài đặt. Các tùy chọn phần mềm miễn phí như SharePod hoặc PodTrans cho phép người dùng xem sao chép hoặc di chuyển các tệp nhạc từ máy tính Windows sang iPod. Podworks và PodUtil lần lượt phục vụ cùng một mục đích cho OSX và Linux. Mỗi chương trình có một giao diện mà qua đó người dùng chọn vị trí của nhạc trên máy tính của họ, cho dù họ muốn sao chép hay chuyển nó và nơi họ muốn lưu nó trên iPod.