Elizabeth Proctor bị Mary Warren buộc tội là phù thủy trong Cuộc thử thách phù thủy Salem vào năm 1692. Lúc đó bà đang mang thai nên không bị xử tử vào thời gian đã định. Khi đứa con của Elizabeth được sinh ra, các phiên tòa xét xử phù thủy đã kết thúc và cô ấy đã được ân xá.
Theo Hướng dẫn thành phố Salem Massachusetts, Elizabeth Proctor bị tố cáo là phù thủy vào ngày 28 tháng 3 năm 1692. Vào ngày 11 tháng 4, khi Elizabeth và Sarah Cloyce bị một số quan chức thành phố, bao gồm Phó Thống đốc Thomas Danforth và Đại úy Samuel, kiểm tra tại tòa án. Sewall, cả hai người phụ nữ đều bị buộc tội là phù thủy và bị bỏ tù.
Elizabeth Proctor vẫn ở trong tù ở Salem cho đến đầu tháng 8, khi cô bị đưa ra xét xử vì tội phù thủy và bị kết án. Các phù thủy khác bị buộc tội tại tòa án ngày hôm đó, bao gồm cả John, chồng của Elizabeth, bị treo cổ trên Đồi Gallows khét tiếng, nhưng Elizabeth được cho tạm trú thi hành án vì đang mang thai.
Vào thời điểm Elizabeth Proctor sinh con, Các Thử nghiệm Phù thủy Salem đã kết thúc. Elizabeth được ân xá và ra tù. Tuy nhiên, theo luật, cô vẫn là một tội phạm bị kết án. Điều này ngăn cản Elizabeth đòi bất kỳ tài sản nào của chồng cô là John Proctor. Điều này bao gồm cả quán rượu gia đình mà cô điều hành trong nhiều năm. Vào năm 1697, 5 năm sau Vụ xét xử phù thủy, một tòa án chứng thực đã khôi phục lại của hồi môn cho Elizabeth Proctor.
Vào ngày 17 tháng 12 năm 1710, Elizabeth Proctor được trả 578 bảng Anh và 12 shilling để bồi thường cho cái chết của chồng cô, John.