Nhật Bản là một quốc đảo ở Đông Á. Nó là một quần đảo bao gồm tổng cộng 6.852 hòn đảo. Nó giáp với Bắc Thái Bình Dương, Biển Philippines, Biển Hoa Đông và Biển Nhật Bản. Bốn quần đảo Home, Hokkaid ?, Honsh ?, Shikoku và Ky? Sh ?, chiếm khoảng 97 phần trăm diện tích đất liền của đất nước. Thủ đô Tokyo nằm trên Honsh ?.
Núi và rừng bao phủ khoảng 72% diện tích Nhật Bản. Độ cao cao nhất trong cả nước là Núi Phú Sĩ, nằm trên Honsh ?, có đỉnh ở độ cao 12.388 feet so với mực nước biển. Các ngọn núi lớn khác trong nước bao gồm núi Tate và núi Haku. Dãy núi Hida, Kiso và Akaishi là một phần của dãy Alps của Nhật Bản, với núi Kita có đỉnh cao nhất trong dãy này. Nhật Bản cũng có 108 ngọn núi lửa đang hoạt động.
Sông Shinano là con sông dài nhất trong cả nước. Hồ lớn nhất là hồ Biwa. Độ cao thấp nhất được tìm thấy tại Hachir? Gata, hồ lớn thứ hai trong cả nước cho đến khi bắt đầu cải tạo đất vào những năm 1950. Độ cao của hồ thấp hơn mực nước biển bốn mét.
Đường bờ biển ở Nhật Bản dài 18.486 dặm. Phần lớn đất đai thích hợp cho sinh sống và trồng trọt nằm dọc theo các bờ biển.