Mục đích của việc thay đổi chế độ ăn uống được quy định trong những ngày trước khi nội soi là để làm sạch ruột hoàn toàn, theo Trường Y Harvard. Một đại tràng trống cho phép bác sĩ xem bất kỳ sự phát triển bất thường nào trong dấu hai chấm rõ ràng hơn.
Vài ngày trước khi nội soi, bệnh nhân nên loại bỏ chất xơ ra khỏi chế độ ăn uống của họ. Điều này có nghĩa là loại bỏ sản phẩm thô, trái cây khô, hạt, quả hạch và ngũ cốc nguyên hạt. Trong ngày ngay trước khi nội soi, bệnh nhân nên tránh tất cả các thức ăn đặc. Thay vào đó, họ nên ăn những chất lỏng trong như trà, cà phê đen, rượu bia hoặc nước dùng. Nước ngọt có ga được chấp nhận, cũng như Jell-O, kem que và đồ uống thể thao. Theo báo cáo của Trường Y Harvard, vào ngày tiến hành nội soi, chế độ ăn uống rõ ràng tương tự là cần thiết cho đến hai giờ trước khi làm thủ thuật, khi tất cả việc ăn uống phải dừng lại, theo báo cáo của Trường Y Harvard.
Vào buổi chiều hoặc buổi tối trước ngày nội soi, bác sĩ kê toa một loại chất lỏng chuẩn bị để dẫn đến loại tiêu chảy giúp tống khứ hoàn toàn đại tràng ra ngoài. Các bước chính xác để thực hiện điều trị thay đổi tùy theo sự chuẩn bị cụ thể mà bác sĩ muốn bệnh nhân sử dụng. Một số phương pháp liên quan đến việc uống một gallon chất lỏng chuẩn bị vào ngày hôm trước, trong khi những phương pháp khác kết hợp uống nửa ngày trước và nửa ngày còn lại vào ngày điều trị, Trường Y Harvard lưu ý.