Các rủi ro ngay sau khi cắt bỏ buồng trứng bao gồm sự phát triển của các mô sẹo gây đau đớn và nhiễm trùng liên quan đến chính quy trình phẫu thuật, theo Breastcancer.org. Cắt bỏ buồng trứng đưa một phụ nữ ở tuổi tiền mãn kinh vào thời kỳ mãn kinh, khiến không thể thụ thai con cái, và có thể dẫn đến các triệu chứng mãn kinh dữ dội.
Trong những tuần sau phẫu thuật, phụ nữ sẽ cảm thấy đau và mệt mỏi khi cơ thể hồi phục. Các tác dụng phụ này là điển hình của cả quy trình phẫu thuật nội soi và ổ bụng, Breastcancer.org giải thích. Các triệu chứng mãn kinh sau khi cắt bỏ buồng trứng được mô tả là bốc hỏa mạnh và đột ngột, mệt mỏi, thay đổi tâm trạng và kích ứng âm đạo. Khởi phát các triệu chứng mãn kinh diễn ra trong những ngày và tuần sau phẫu thuật, và xảy ra cùng với quá trình hồi phục sau phẫu thuật. Một số phụ nữ cũng bị trầm cảm liên quan đến mất khả năng sinh sản và thay đổi kinh nghiệm tình dục.
Theo thời gian, việc cắt bỏ buồng trứng có thể làm tăng nguy cơ loãng xương liên quan đến việc bắt đầu mãn kinh không tự nhiên. Theo một nghiên cứu của Phòng khám Mayo năm 2006 được báo cáo trên trang Breastcancer.org. Tác dụng phụ lâu dài không được biết đầy đủ, nhưng người phụ nữ đã cắt bỏ buồng trứng đã bị đau cơ và khớp, tim đập nhanh mãn tính, mất ngủ, tái phát nhiễm trùng đường tiết niệu và nấm men, tiểu tiện không tự chủ, lo lắng, trầm cảm và thay đổi tâm trạng. Có nhiều ý kiến trái chiều trong cộng đồng y tế về việc sử dụng liệu pháp thay thế hormone để giảm bớt các triệu chứng này, kể từ năm 2014.