Các tác dụng phụ của Depo-Provera bao gồm kinh nguyệt không đều, đau đầu và căng thẳng, theo WebMD. Các tác dụng phụ khác có thể xảy ra là chóng mặt và trầm cảm. Một số người dùng cũng bị mụn trứng cá hoặc thay đổi cảm giác thèm ăn.
Theo giải thích của WebMD, hầu hết các tác dụng phụ của Depo-Provera là không phổ biến. Khoảng một nửa số phụ nữ dùng Depo-Provera hết kinh sau năm đầu tiên. Đối với phụ nữ dùng Depo-Provera trong hơn hai năm, có nguy cơ cao bị loãng xương và các vấn đề khác về mật độ xương. Các bác sĩ khuyến cáo phụ nữ sử dụng Depo-Provera nên bổ sung canxi và vitamin D để giúp ngăn ngừa mất xương và loãng xương.