Nguyên nhân mắc phải của số lượng tế bào lympho thấp bao gồm liệu pháp steroid; Rối loạn tự miễn dịch; xạ trị; hóa trị liệu; các bệnh về máu như ung thư máu; và các bệnh truyền nhiễm như bệnh lao, Viện Tim, Phổi và Máu Quốc gia giải thích. Nguyên nhân di truyền của số lượng tế bào lympho thấp bao gồm dị thường DiGeorge và hội chứng Wiskott-Aldrich.
Số lượng tế bào lympho thấp xảy ra khi cơ thể tạo ra một số lượng nhỏ tế bào lympho hoặc khi cơ thể tạo đủ tế bào lympho nhưng chúng bị phá hủy, theo Viện Tim, Phổi và Máu Quốc gia. Một số bệnh nhân có lượng tế bào lympho thấp do các tế bào lympho bị mắc kẹt trong các hạch bạch huyết hoặc lá lách. Có những bệnh nhân bị lượng tế bào lympho thấp mà không có nguyên nhân nào có thể giải thích được.
Theo báo cáo của Viện Tim, Phổi và Máu Quốc gia, một trong những nguyên nhân phổ biến nhất gây ra số lượng tế bào lympho thấp là hội chứng suy giảm miễn dịch mắc phải. Điều này là do nhiễm vi rút gây suy giảm miễn dịch ở người phá hủy các tế bào T CD4 +, MSD Manual giải thích. Suy dinh dưỡng năng lượng protein là một nguyên nhân phổ biến khác của chứng giảm bạch cầu.
Số lượng tế bào lympho thấp có thể là kết quả của việc sản xuất thiếu tế bào lympho do phá hủy cấu trúc lymphoid hoặc tuyến ức, Hướng dẫn sử dụng MSD nêu rõ. Các tế bào lympho cũng có thể di chuyển đến đường hô hấp. Một số phương pháp điều trị bệnh vẩy nến dài hạn có thể phá hủy tế bào T và gây ra số lượng tế bào lympho thấp. Mức độ tế bào bạch huyết có thể giảm trong thời gian ngắn khi một người đói, căng thẳng hoặc sử dụng corticosteroid.