Có nhiều nguyên nhân tiềm ẩn gây đau cổ họng và đau tai khi nuốt, tuy nhiên, lý do phổ biến nhất là chảy dịch mũi sau do dị ứng. WebMD nói rằng chảy nước mũi sau là một phản ứng phổ biến đối với dị ứng và cảm lạnh , có thể dẫn đến nhiễm trùng tai và nhiễm trùng cổ họng do kích ứng nhỏ giọt liên tục.
Theo WebMD, hiện tượng chảy nước mũi sau sinh tồn tại là do cơ thể con người có các tuyến bên trong cổ họng và mũi. Các tuyến này tiết ra chất nhờn để giữ cho những vùng này sạch sẽ và sau đó chất nhầy này được nuốt vào bụng mà không báo trước. Khi bị ốm hoặc bị dị ứng, họ thường tiết dịch bất thường. Học viện Tai Mũi Họng, Phẫu thuật Đầu và Cổ của Mỹ cho biết những chất tiết bất thường này có thể được nhìn thấy trong dịch mũi sau.AAO-HNS cho biết hiện tượng chảy nước mũi sau khi chảy nước mũi khó chịu cũng có thể là kết quả của các vấn đề về nuốt và trào ngược axit do GERD. Sự kích thích liên tục này từ hiện tượng chảy dịch mũi sau nặng hơn nhiều dẫn đến viêm họng và cũng có thể dẫn đến sưng amidan. WebMD cũng báo cáo rằng nhiễm trùng tai rõ ràng hơn trong quá trình nuốt khi nó xảy ra. Những lý do gây chảy dịch mũi sau có thể không chỉ do cảm lạnh thông thường và dị ứng, chẳng hạn như nhiễm trùng xoang, thuốc men, vách ngăn lệch và thậm chí là một số loại thực phẩm hoặc nước hoa.