Charles Krauthammer sinh ra ở New York vào năm 1950 và cùng cha mẹ chuyển đến Canada nói tiếng Pháp khi còn nhỏ. Ông đã kết hôn với họa sĩ và nhà điêu khắc Robyn Krauthammer và có một con trai tên là Daniel. sinh năm 1986. Cả Charles và Robyn Krauthammer đều là những người quảng bá âm nhạc và văn hóa Do Thái, đồng thời là người đồng sáng lập "Pro Musica Hebraica", một tổ chức văn hóa có trụ sở tại Washington. Cả hai luôn quan tâm đến văn hóa và truyền thống của người Do Thái. Tiến sĩ Krauthammer đã qua đời vào ngày 21 tháng 6 năm 2018 vì bệnh ung thư ruột non.
Charles Krauthammer lớn lên trong một gia đình Do Thái Chính thống nghiêm khắc. Cha anh là người Pháp và mẹ anh sinh ra ở Bỉ. Họ quyết định chuyển từ New York đến Montreal khi Charles còn trẻ. Ông giữ một cuộc sống rất riêng tư và hiếm khi chia sẻ chi tiết về gia đình của mình với công chúng, ngoại trừ một số đề cập đến con trai Daniel trong cuốn sách "Những điều quan trọng". Ông kết hôn với Robyn Krauthammer vào năm 1974 và cả hai đều thông thạo tiếng Do Thái. Họ cùng nhau điều hành một tổ chức văn hóa chuyên tổ chức các buổi hòa nhạc quảng bá âm nhạc Do Thái. Hai người gặp nhau khi theo học Đại học Oxford ở Anh. Vào thời điểm đó, Robyn là một sinh viên Úc gốc Do Thái, cũng là thư ký luật cho văn phòng chánh án.
