Không thể du hành đến vũ trụ trong Pok? mon Emerald. Người chơi đến thăm Trung tâm Không gian Mossdeep trong suốt trò chơi nhưng thực sự không thể lên một tên lửa để đi vào không gian.
Tin đồn rằng có khả năng đi vào không gian có thể bắt đầu từ Pok? mon Deoxys, được cho là đến từ không gian. Tuy nhiên, Deoxys có được tại Đảo Sinh Tồn trong trò chơi này. Các cuộc thử nghiệm được tiến hành định kỳ tại nhà ga và một nhà khoa học ở đó đưa ra số lượng hiện tại của các cuộc thử nghiệm thành công, nhưng người chơi không thể tham gia chúng theo bất kỳ cách nào. Con số mà nhà khoa học đưa ra thực sự tương ứng với số tuần đã trôi qua kể từ khi trò chơi hiện tại bắt đầu.
Trong suốt trò chơi, Đội Magma tiếp quản Trung tâm Không gian và người chơi phải lấy lại từ họ. Sự kiện này xảy ra ngay sau khi người chơi kiếm được Mind Badge từ Mossdeep Gym. Khi Đội Magma đã kiểm soát được cơ sở, người chơi phải dọn sạch tất cả các Grunts của Đội Magma từ tầng đầu tiên. Sau khi hoàn tất, người chơi có thể lên tầng hai, nơi họ gặp Steven Stone. Stone tham gia cùng người chơi trong trận chiến tay đôi với Maxie và Tabatha.
