Một số nhân vật Pokémon phổ biến nhất bao gồm Pikachu, Mewtwo, Squirtle, Charmander và Bulbasaur. Những Pokémon này được người hâm mộ xếp hạng cao và tất cả đều xuất hiện trong các bộ phim và chương trình truyền hình của nhượng quyền thương mại.
Dễ dàng trở thành nhân vật mang tính biểu tượng nhất trong loạt phim, Pikachu là Pokémon song hành và là linh vật ban đầu của nhượng quyền thương mại. Loài gặm nhấm điện tí hon không thể tách rời khỏi Pokémon, và là một trong những nhân vật duy nhất có thể được nhận ra ngay cả với những người không biết gì về bộ truyện. Mặc dù những người hâm mộ khó tính có thể không đánh giá cao sự bão hòa quá mức của anh ấy, nhưng không thể phủ nhận sự nổi tiếng của Pikachu.
Là Pokémon hiếm nhất và mạnh nhất trong các hóa thân gốc “Đỏ” và “Xanh” của loạt phim, sự nổi tiếng của Metwo đã được đảm bảo ngay từ khi bắt đầu nhượng quyền thương mại. Một Pokémon tâm linh mạnh mẽ, Mewtwo ẩn sâu trong Unknown Dungeon, một khu vực chỉ có thể tiếp cận được sau khi người chơi hoàn thành phần còn lại của trò chơi. Sự nổi tiếng của Mewtwo đã dẫn đến sự xuất hiện trên các phương tiện truyền thông khác, bao gồm bộ phim Pokémon đầu tiên và trò chơi chiến đấu nổi tiếng của Nintendo “Super Smash Bros.”
Người chơi bắt đầu phiên bản gốc của Pokémon bằng cách chọn một trong ba Pokémon cơ bản: Bulbasaur, Squirtle hoặc Charmander. Đại diện cho ba trong số các loại nguyên tố chính của sê-ri, cỏ, nước hoặc lửa, Pokemon "khởi đầu" ban đầu phát triển thành một số sinh vật mạnh nhất trong trò chơi. Lịch sử, tính hữu dụng và sự xuất hiện nổi bật của chúng trong loạt phim truyền hình Pokémon gốc khiến Bulbasaur, Squirtle và Charmander trở thành ba trong số những Pokémon phổ biến nhất.