Các khối u dưới da có thể do nhiều nguyên nhân, bao gồm u mỡ, tuyến bạch huyết mở rộng, u nhọt, u sợi thần kinh, u da và một số bệnh ung thư như keratoacanthoma, theo WebMD và Patient.info. Ví dụ, u mỡ là những khối u làm từ mô mềm, xảy ra đơn lẻ hoặc thành từng nhóm nhỏ, WebMD giải thích. Các tuyến hoặc hạch bạch huyết bị sưng xuất hiện dưới dạng cục u trên cổ khi bị nhiễm virus như viêm họng, như eMedicineHealth đã nêu.
Theo báo cáo của WebMD, u nang dưới da và u sợi thần kinh cũng là những khối u mềm biểu hiện dưới dạng một hoặc nhiều cục u thường vô hại. U nang da dưới da là một vùng nhỏ dưới da chứa đầy mủ hoặc các chất lỏng khác và xuất hiện do sự tắc nghẽn của các tuyến dầu trên da. Các nguyên nhân khác gây ra nhiều cục u dưới da bao gồm u mạch anh đào và dày sừng pilaris.
Theo BootsWebMD, u mạch anh đào là những u nhỏ màu anh đào có thể nhìn thấy trên thân và không cần điều trị trừ khi chúng chảy máu hoặc nổi rõ trên mắt, theo BootsWebMD. Bệnh dày sừng da cánh tay xuất hiện dưới dạng nhiều mụn trắng hoặc đỏ dưới da và thường được tìm thấy trên đùi, mông, cánh tay trên và lưng, BootsWebMD cho biết. Tuy nhiên, tình trạng này không gây đau đớn và vô hại.