Việc điều trị nhiễm trùng xoang phù hợp tùy thuộc vào việc nhiễm trùng là do vi khuẩn hay vi rút. Các chuyên gia của CDC nói rằng liệu pháp kháng sinh là không cần thiết trừ khi một người bị nhiễm trùng cấp tính do vi khuẩn gây ra. Nếu nhiễm trùng do vi rút gây ra, bệnh thường tự khỏi, mặc dù những người bị nhiễm trùng xoang có thể sử dụng thuốc không kê đơn để điều trị các triệu chứng.
CDC giải thích hầu hết các bệnh nhiễm trùng xoang là do vi rút; tuy nhiên, WebMD tuyên bố rằng 90 phần trăm người lớn được kê toa một đợt kháng sinh cho bệnh nhiễm trùng xoang của họ. Đây là một vấn đề nghiêm trọng vì lạm dụng kháng sinh có thể dẫn đến kháng kháng sinh.
Đối với những người muốn tránh dùng thuốc kháng sinh, có thể điều trị các triệu chứng của nhiễm trùng xoang trong khi hệ thống miễn dịch chống lại sinh vật vi phạm. Đối với tắc nghẽn, MedlinePlus khuyên bạn nên sử dụng máy tạo độ ẩm và hít hơi nước từ hai đến bốn lần mỗi ngày. Uống nước trong sẽ làm loãng chất nhầy, giúp chất nhầy thoát ra dễ dàng hơn. Ngoài ra còn có các loại thuốc để làm sạch chất nhầy ra khỏi đường mũi. Những loại thuốc này được gọi là thuốc thông mũi. Theo eMedicineHealth, Acetaminophen làm giảm đau và sốt do nhiễm trùng xoang, nhưng nó không kiểm soát tình trạng viêm như ibuprofen.
Ở những người khỏe mạnh, amoxicillin liều cao là loại thuốc được lựa chọn để điều trị nhiễm trùng xoang, theo Học viện Phẫu thuật Tai mũi họng Hoa Kỳ. Nếu tình trạng nhiễm trùng không thuyên giảm, bác sĩ có thể kê đơn thuốc kháng sinh được thiết kế để điều trị một số loại vi khuẩn khác nhau.