Theo Disinfected, có ba loại chất khử trùng chính: rượu, clo và andehit. Rượu isopropyl và etanol là những ví dụ về rượu được sử dụng để khử trùng bề mặt. Formaldehyde là ví dụ phổ biến nhất về chất khử trùng bằng aldehyde. Wikipedia tuyên bố rằng chất khử trùng được áp dụng cho các bề mặt không còn sống vì mục đích kháng khuẩn. Chúng khác với thuốc sát trùng và thuốc kháng sinh, được sử dụng làm chất kháng khuẩn cho các sinh vật sống.
Ngoài các loại chất khử trùng chính, có nhiều loại chất khử trùng khác, bao gồm chất khử trùng không khí, chất oxy hóa, phenol, hợp chất amoniac bậc bốn, hợp kim bạc và đồng. Hợp kim đồng được biết là có tác dụng chống lại vi khuẩn E. coli, vi rút cúm A, vi rút adenovirus và nấm, cùng các vi khuẩn khác. Các chất khử trùng không khí thường được phân phối ở dạng bình xịt hoặc hơi và phải có nồng độ thích hợp trong không khí để có hiệu quả chống lại các vi khuẩn trong không khí. Sản phẩm gia dụng thông thường Lysol là một ví dụ điển hình về chất khử trùng không khí. Chất khử trùng không khí thường là glycol, chẳng hạn như propylene glycol hoặc triethylene glycol. Các nghiên cứu đã chỉ ra rằng chúng có hiệu quả chống lại nấm mốc, vi rút cúm, vi khuẩn và penicillium chrysogenum. Ethanol và isopropanol thường được sử dụng làm chất khử trùng hơn là chất khử trùng, mặc dù chúng là những chất kháng khuẩn rất hiệu quả.