Một số công việc sửa chữa đường ống thoát nước của bể tự hoại thông thường bao gồm loại bỏ tắc nghẽn và mùi hôi. Một cách sửa chữa phổ biến khác là phá vỡ dầu mỡ sau khi tích tụ gây tắc nghẽn đường ống tự hoại.
Thay thế hoặc vá đường ống bị hỏng là một cách sửa chữa khác thường được thực hiện khi các cánh đồng thoát nước của bể tự hoại không hoạt động bình thường. Nhiều công việc sửa chữa như tháo guốc có thể được thực hiện bởi chủ nhà nếu họ có trong tay sản phẩm phù hợp. Chất oxy hóa và chất phụ gia có thể được sử dụng để nới lỏng hoặc loại bỏ tắc nghẽn. Các sản phẩm được sử dụng chính xác nên an toàn cho bể tự hoại. Một số vấn đề, chẳng hạn như đường ống bị vỡ hoặc nứt, thường cần một chuyên gia để sửa chữa vì điều này đòi hỏi các bản sửa lỗi chuyên sâu hơn.
