Nói chung, việc làm sạch hệ thống thoát nước mưa là tùy thuộc vào thành phố hoặc đô thị địa phương, nhưng các cá nhân có thể dùng tay hoặc cào để loại bỏ lá, que, bụi bẩn và mảnh vụn bám trên lưới dẫn vào hệ thống thoát nước mưa. Các cá nhân chỉ nên cố gắng làm sạch lưu vực hứng này chứ không phải tự thoát nước mưa.
Theo Cơ quan Bảo vệ Môi trường Hoa Kỳ, hệ thống thoát nước mưa cần được làm sạch thường xuyên để giảm lượng rác, mảnh vụn và các chất ô nhiễm khác trong cả hệ thống thoát nước mưa và nước tiếp nhận. Trong hầu hết các trường hợp, thành phố thuê dịch vụ sửa ống nước để làm sạch cống, được thực hiện bằng cách xả nước qua hệ thống để loại bỏ cặn bẩn và cặn bẩn bị mắc kẹt.
Nếu hệ thống thoát nước mưa không được vệ sinh thường xuyên, nó có thể khiến cống và cửa vào bị tắc. Điều này có thể khiến hệ thống bị tràn, dẫn đến gia tăng xói mòn trong khu vực. Xả nước thường xuyên hệ thống thoát nước mưa giúp tăng lượng oxy hòa tan trong nước và giảm mức độ vi khuẩn.
Mặc dù xả nước là phương pháp được khuyến nghị để làm sạch cống thoát nước mưa, nhưng phương pháp này vẫn có những hạn chế, vì nó hiệu quả hơn trong các đường ống có đường kính nhỏ hơn 36 inch và khi chiều dài của đường ống được làm sạch nhỏ hơn 700 feet.
