Cốt truyện trong chế độ Zombie của "Call of Duty Black Ops 2" xoay quanh Edward Richtofen sau các sự kiện của DLC mặt trăng từ "Call of Duty Black Ops". Chế độ câu chuyện, có tên Tranzit, cho phép người chơi cố gắng giải quyết bí ẩn về lý do tại sao Trái đất đang chết trong khi chiến đấu với vô số zombie. Người chơi nhận được sự hỗ trợ từ cả Richtofen và Tiến sĩ Maxis.
Theo trang web chính thức của "Call of Duty", mặc dù chế độ Zombie của "Call of Duty" không có cốt truyện, nhưng nó không phải là một chiến dịch do tính năng vô tận của nó. Ngay cả chế độ Tranzit trong "Black Ops 2", trong khi nó tập trung vào các khía cạnh câu chuyện, chủ yếu là một trò chơi dựa trên điểm số. "Black Ops 2" có bốn chế độ Zombie khác nhau. Tranzit là một đám zombie vô tận với nhiều khía cạnh câu chuyện khác nhau và một thế giới mở. Chế độ sinh tồn diễn ra trong một phân đoạn cụ thể của thế giới mở Tranzit và đưa người chơi chống lại một đám đông vô tận. Chế độ Grief đặt các nhóm gồm bốn người chơi là con người chống lại nhau cũng như chống lại thây ma. Người chơi có thể chọn chiến đấu với nhau hoặc cố gắng sử dụng thây ma để có lợi cho mình. Cuối cùng, các trò chơi tùy chỉnh cho phép người chơi điều chỉnh các loại vật phẩm, cách tiêu diệt thây ma và giới hạn thời gian trong trò chơi của họ.
