Thẻ Pokémon hiếm nhất là thẻ Pikachu Illustrator. Chỉ có bốn thẻ tồn tại trên thế giới và một thẻ gần đây đã được bán trên eBay với giá 100.000 đô la.
Các thẻ Pokémon hiếm khác bao gồm thẻ Huấn luyện viên số 1, 2 và 3; các thẻ Raichu trước khi phát hành; và các thẻ Tropical Mega Battle 2001. Độ hiếm của thẻ Huấn luyện viên số 1, 2 và 3 là do một thẻ được phát hành mỗi năm trong thời gian diễn ra Chung kết thế giới TCG. Các nhà xuất bản giới hạn thẻ Raichu trước khi phát hành từ 10 đến 15 thẻ trên toàn thế giới, với giá trị ước tính trên 10.000 đô la cho mỗi thẻ. Các nhà xuất bản giới hạn thẻ Tropical Mega Battle 2001 là 12 thẻ, vì vậy chúng được bán với giá hơn 10.000 đô la.