"Yu-Gi-Oh!" các tầng của bộ bài giới thiệu một loại nguyên mẫu bộ bài cụ thể này với một loại nguyên mẫu bộ bài cụ thể khác dựa trên khả năng chơi, thống kê chiến thắng trong giải đấu và các lá bài được sử dụng. Bậc của một bộ bài càng cao, bộ bài đó càng có cơ hội thắng một trận đấu trong một giải đấu chính thức. Ví dụ: bộ bài bậc "0" và bậc "1" là những bộ bài được xếp hạng cao nhất trong trò chơi bài giao dịch, trong khi bộ bài bậc "2" và bậc "3" trở xuống không mạnh bằng.
Kể từ tháng 9 năm 2014, không có danh sách cấp bộ bài chính thức nào tồn tại trực tuyến, nhưng một số người đam mê và trò chơi máy tính cố gắng xếp hạng bộ bài để có tỷ lệ chiến thắng cao hơn. Bộ bài "D-Zombie" đề cao tốc độ và tính nhất quán của nó để mang lại những lá bài quái vật khả thi. Nguyên mẫu zombie phát triển mạnh khi mang quái vật trở lại từ nghĩa địa của người chơi để tái sử dụng chúng trong trò chơi. Các thây ma cũng xây dựng lẫn nhau bằng cách triệu hồi những quái vật mạnh hơn khi có nhiều quái vật cấp thấp hơn trên chiến trường.
Blog "Yugiold" vào tháng 12 năm 2013 giới thiệu các bộ bài hàng đầu cho tất cả 157 loại nguyên mẫu của trò chơi bài. Các bộ bài hàng đầu bao gồm các nguyên mẫu Mermail, Bujin, Fire Fist, Geargia, Maldoche và Noble Knight. Thẻ Geargia sử dụng quái vật dạng máy. Blog này cũng đề cập đến sự đa dạng là chìa khóa để giành chiến thắng trong nhiều trận đấu và giải đấu hơn vì không có bộ bài duy nhất nào thống trị nhờ các bản phát hành thẻ vào năm 2014.
TCGPlayer.com chứa danh sách xếp hạng do một số người chơi thực hiện. Bất kỳ ai cũng có thể nhấp vào các bộ bài này để xem chính xác cách chúng được cấu tạo. Chìa khóa của "Yu-Gi-Oh!" các tầng của bộ bài là trải nghiệm các bộ bài hàng đầu khác nhau để xem chúng hoạt động như thế nào.