Người dùng có thể vệ sinh hoặc thay thế bộ lọc trong máy điều hòa không khí dạng cửa sổ. Một số máy có bộ lọc có thể tái sử dụng, người dùng rửa và lắp lại vào máy điều hòa không khí. Các bộ lọc khác không thể được sử dụng lại và cần được thay thế.
Vệ sinh hoặc thay thế bộ lọc cũ, bẩn có thể cắt giảm mức sử dụng năng lượng của máy điều hòa từ 5 đến 15%, theo Bộ Năng lượng Hoa Kỳ. Chủ sở hữu nên rửa hoặc thay bộ lọc không khí mỗi tháng một lần trong mùa làm mát để tránh bụi bám vào các cuộn dây của dàn bay hơi. Cần vệ sinh thường xuyên hơn nếu thiết bị được sử dụng quá mức, khu vực có nhiều bụi hoặc nhà có vật nuôi.