Một số điểm khác biệt giữa "Ms. Pacman" và "Pacman" bao gồm việc bổ sung thêm một cặp đường hầm dọc ở ba trong bốn mê cung của trò chơi. Ngoài ra, bản thân các mê cung cũng khác với các trò chơi "Pacman" ban đầu.
Trong trò chơi "Bà Pacman", các kiểu hành vi của các hồn ma khác với trong "Pacman" và chúng cũng bao gồm một yếu tố ngẫu nhiên trong chuyển động của các hồn ma. Điều này ngăn người chơi ghi nhớ các hình thức mà bóng ma di chuyển, khiến trò chơi khó hơn một chút so với "Pacman".
Trái cây trong trò chơi cũng hoạt động khác nhau. Thay vì sinh sản ở trung tâm của bản đồ, các loại trái cây trong "Bà Pacman" nảy dọc theo mê cung theo kiểu ngẫu nhiên, đi vào và đi ra từ các đường hầm dọc trong mỗi mê cung. Ngoài ra, một khi mỗi trái cây đã được bắt gặp, chúng sẽ sinh sản theo kiểu ngẫu nhiên. Điều này bắt đầu ở vòng thứ 8.
Các thay đổi cũng được thực hiện đối với hình ảnh động về cái chết của bà Pacman. Thay vì tự thu mình lại và biến mất như Pacman, cô Pacman chỉ cần xoay người xung quanh bất cứ khi nào cô chạm vào một hồn ma. Hiệu ứng âm thanh khi cô ấy chết cũng được thay đổi, cũng như nhiều âm thanh khác trong trò chơi.
"Bà Pacman" gặp lỗi trong các chương trình con khiến trò chơi không thể chơi được sau vòng thứ 256. Tuy nhiên, nhiều lỗi khác xuất hiện sớm hơn nhiều trong quá trình chơi, khiến người chơi khó có thể đạt đến vòng thứ 256 mà không sử dụng tính năng mô phỏng.