Có nhiều tranh luận về việc liệu Roundup có an toàn hay không, đó là lý do tại sao Văn phòng Thuốc trừ sâu của Cơ quan Bảo vệ Môi trường đang có kế hoạch tiến hành đánh giá các nguy cơ tiềm ẩn đối với sức khỏe của nó vào năm 2015. Cũng như các loại thuốc diệt cỏ khác, cần phải cẩn thận khi sử dụng Roundup , vì nó là một chất độc.
Cơ quan Bảo vệ Môi trường coi hoạt chất trong thuốc diệt cỏ Roundup có độc tính thấp nếu được sử dụng ở mức khuyến cáo, nhưng hai trong số các thành phần của nó có khả năng gây ra các vấn đề sức khỏe nghiêm trọng, thậm chí gây tử vong.
Một số nghiên cứu đã liên kết glyphosphate, thành phần hoạt chất trong Roundup, làm tăng nguy cơ dị tật bẩm sinh, sẩy thai, rối loạn sinh sản và một số loại ung thư. Hơn nữa, một trong những thành phần trơ trong Roundup, polyethoxylated tallowamine, đã được chứng minh là có thể gây chết tế bào nhau thai, phôi thai và tế bào rốn của con người trong một nghiên cứu được thực hiện tại Đại học Caen ở Pháp. Trong nghiên cứu này, POEA thực sự được chứng minh là độc hại đối với tế bào hơn thuốc trừ sâu thực tế.
Monsanto, công ty sản xuất Roundup, tiếp tục tuyên bố rằng sản phẩm đã nhiều lần được chứng minh là an toàn, bất chấp các nghiên cứu đã đề xuất khác. Nghiên cứu năm 2015 của FDA sẽ xác định liệu sản phẩm có tiếp tục được cung cấp hay không hay liệu việc sử dụng nó có bị hạn chế hay không.