Theo Bulbapedia, có bốn trục trặc trong cả Pokemon Fire Red và Pokemon Leaf Green. Những lỗi này ảnh hưởng đến Infinite Nugget, Poke Flute, Roaming Roar và Low IV. Những trục trặc này khác với Đỏ, Xanh lục và Xanh lam của Thế hệ I.
Lỗi đầu tiên là trục trặc của Infinite Nugget. Về mặt kỹ thuật, đây không phải là một trục trặc, nhưng nó thường được coi là một. Để nhận cốm vô hạn, người chơi cần thua và chơi lại thủ lĩnh Rocket Grunt ở cuối Nugget Bridge. Mỗi khi người chơi thua cuộc, Rocket Grunt sẽ mang lại cho người chơi một viên đạn nhỏ. Grunt có thể chơi với số lần vô hạn, nghĩa là người chơi có thể nhận được vô số cốm.
Lỗi thứ hai là trục trặc của Poke Flute. Sự cố này cho phép người chơi tắt tiếng nhạc Poke Flute khi phát. Để thực hiện việc này, chỉ cần kích hoạt và hủy kích hoạt menu trợ giúp khi Poke Flute đang phát.
Lỗi thứ ba là trục trặc trong Roaming Roar. Đây là một trục trặc khiến mọi Pokemon chuyển vùng biến mất khỏi toàn bộ trò chơi nếu Pokemon đó sử dụng Roar trong trận chiến.
Sự cố cuối cùng trong Thế hệ III là lỗi IV thấp. Sự cố này là kết quả của việc thiếu mã. Nó cung cấp cho Pokemon chuyển vùng cấp IV thấp, trong khi không ảnh hưởng đến HP, sẽ làm giảm tất cả các chỉ số khác như tấn công và phòng thủ. Điều này thật không may cho những người huấn luyện IV muốn tối đa hóa khả năng của Pokemon. Các trục trặc được tìm thấy trong Thế hệ I, chẳng hạn như trục trặc Thiếu số, đã bị loại bỏ khỏi các bản làm lại.
