Lập trình viên Thụy Điển Markus Persson ban đầu đã tạo "Minecraft" như một dự án cuối tuần vào tháng 5 năm 2009 bằng cách sử dụng các công cụ mã hóa đơn giản. Anh ấy đã xây dựng trên nền tảng này trong chu kỳ phát triển 30 tháng. Persson đã thuê các lập trình viên khác và tạo ra studio trò chơi Mojang để hỗ trợ trong quá trình tạo ra sau khi những lời truyền miệng tích cực quá mức khiến các phiên bản phát triển của trò chơi trở thành một hit lớn.
Persson, người còn được biết đến với tay cầm Internet Notch, đã được truyền cảm hứng để tạo ra "Minecraft" sau khi trải nghiệm trò chơi nổi bật và sâu sắc của một chương trình có tên "Pháo đài người lùn". Nhận thấy rằng "Pháo đài người lùn" có đồ họa nhân vật ASCII nguyên thủy, Persson quyết định tạo ra một trò chơi thế giới mở tương tự, thú vị hơn về mặt hình ảnh xoay quanh sự lựa chọn của người chơi dường như không giới hạn. Thể loại trò chơi này kể từ đó được biết đến như một trò chơi hộp cát do cách người chơi gần như được thả vào một thế giới nhỏ để xây dựng bất cứ thứ gì họ có thể tưởng tượng.
Persson đã tải các phiên bản đầu tiên của "Minecraft" lên các diễn đàn thiết kế trò chơi miễn phí. Trong một vài tháng, anh ấy tiếp tục thêm các tính năng vào chương trình và bắt đầu tính một khoản phí nhỏ để tải xuống cái mà anh ấy gọi là phiên bản alpha của tiêu đề. Khi nó ngày càng trở nên phổ biến, Persson đã thuê các lập trình viên và nhân viên để tiếp tục phát triển "Minecraft".
Persson và Mojang tiếp tục phát triển "Minecraft" trong hai năm tiếp theo trong giai đoạn beta có trả phí mở rộng, trong đó tựa game đã bán được 4 triệu bản. Vào mùa đông năm 2011, Mojang thông báo rằng "Minecraft" đã hoàn thành và hết phiên bản beta, nhưng studio đã tiếp tục bổ sung các tính năng và sự lặp lại của các chế độ chơi hiện có ngay cả sau khi phát hành phiên bản cuối cùng. Các phiên bản của "Minecraft" cũng đã được chuyển sang bảng điều khiển, máy tính bảng và điện thoại thông minh, mở rộng cơ sở người chơi của trò chơi.