Theo Martha Stewart, tất cả các máy pha cà phê nên được vệ sinh mỗi tháng một lần. Các vật dụng duy nhất cần thiết cho dự án làm sạch là giấm trắng và nước chưng cất với lượng tương đương nhau. Đổ hỗn hợp giấm vào bình chứa nước của máy pha cà phê, để yên rồi bật máy. Để một vài cốc chất lỏng chảy qua thiết bị để làm sạch toàn diện.
Tắt máy pha cà phê và để chất lỏng ở trong bình chứa nước ít nhất một giờ. Bật lại thiết bị và để thiết bị hoàn tất chu trình pha. Vứt bỏ hỗn hợp giấm, sau đó cho nước ngọt chảy qua máy pha cà phê trong vài chu kỳ cho đến khi hết mùi giấm. Làm sạch carafe cà phê và giỏ lọc bằng cách cho chúng chạy qua máy rửa bát ở giá trên cùng sau khi cọ rửa lưới lọc bằng bàn chải đánh răng, nếu cần, để loại bỏ bã cà phê tích tụ. Lau bên ngoài thiết bị bằng khăn ẩm. Các sản phẩm thương mại cũng có sẵn để làm sạch và khử cặn cho máy pha cà phê.
Theo Martha Stewart, máy pha cà phê cần được làm sạch mỗi tháng vì cặn dầu do quá trình pha cà phê lặp đi lặp lại. Cặn đó kết hợp với cặn từ nước cứng và các tạp chất khác tích tụ bên trong máy pha cà phê theo thời gian. Phần cặn này ảnh hưởng rất nhiều đến hương vị mịn của tách cà phê.