Trang web ArsTechnica.com và Minecraft wiki tại GamePedia.com cung cấp hướng dẫn chi tiết về cách khởi động máy chủ Minecraft. Người dùng có thể thiết lập máy chủ theo cách thủ công hoặc trả tiền cho máy chủ được định cấu hình trước. Các nhà cung cấp máy chủ như ServerCraft và BeastNode cung cấp các máy chủ Minecraft được cấu hình đầy đủ với một khoản phí hàng tháng. Các bước để định cấu hình máy chủ Minecraft theo cách thủ công bao gồm cài đặt Java Runtime Environment, cài đặt "Minecraft Multiplayer Server" từ trang web Minecraft và thiết lập máy chủ.
Máy chủ Minecraft yêu cầu Java Runtime Environment để chạy, có sẵn tại trang web Java. Vì lý do bảo mật, điều quan trọng là phải cập nhật Java lên phiên bản mới nhất. Nếu bạn cố gắng cài đặt "Minecraft Multiplayer Server" mà chưa cài đặt Java trước, chương trình sẽ mở ra một cửa sổ trình duyệt chuyển hướng đến trang web Java.
Sau khi Java được cài đặt, hãy tải xuống "Máy chủ nhiều người chơi Minecraft" từ Minecraft.com. Người dùng Windows có thể tải xuống chương trình này ở định dạng EXE hoặc ở định dạng JAR. Người dùng Mac và Linux phải tải xuống tệp JAR. Tạo một thư mục cho Minecraft và tải xuống tệp EXE hoặc JAR trong thư mục đó. Sau đó, chạy tệp đã tải xuống để khởi động máy chủ Minecraft. Minecraft wiki và ArsTechnica.com cung cấp hướng dẫn chi tiết về các lệnh để chạy tệp JAR.
Sau khi cài đặt máy chủ Minecraft, người dùng có thể định cấu hình nó theo cách thủ công. Minecraft Wiki có một danh sách chi tiết về các thuộc tính của máy chủ, chẳng hạn như số lượng người chơi, độ khó và chế độ chơi.