Nhiều loài nấm có thể ảnh hưởng đến cây thường xanh, hầu hết trong số đó đòi hỏi các phương pháp điều trị và kiểm soát độc đáo của riêng chúng. Một số vấn đề và bệnh phổ biến hơn do nấm thường xanh gây ra bao gồm thối rễ, bạc lá, bệnh đóng vảy, bệnh đúc kim và bệnh rỉ sắt.
Bệnh nấm da là một trong những loại bệnh thường xanh phổ biến hơn, gây ra bởi sự nhiễm trùng bên trong của bất kỳ một trong số một số loài nấm khác nhau. Những vết chai này là những khu vực vỏ cây chết thường có thể nhìn thấy được do nhựa trắng dính, rỉ ra từ chúng. Nấm làm chết vỏ cây dẫn đến xung quanh bị chết và rụng kim, dân gian thường gọi là bệnh nấm kim châm. Bệnh này chỉ ảnh hưởng đến những cây bị căng thẳng bởi các yếu tố môi trường khác và thường có thể được điều trị bằng cách sục khí và bón phân cho khu vực xung quanh cây.
Nếu cây bị bệnh gỉ sắt hoặc bệnh bạc lá, phương pháp điều trị hiệu quả duy nhất là phun thuốc diệt nấm đã được phê duyệt. Nếu cây bị nấm thối rễ, có khả năng liên quan đến việc thoát nước không đúng cách của đất. Thuốc diệt nấm có thể hữu ích trong trường hợp như vậy, nhưng trước tiên cần giải quyết vấn đề thừa nước để ngăn ngừa nhiễm trùng quay trở lại.