Bông bt là một phiên bản biến đổi gen của thực vật có chứa gen diệt côn trùng. Cây bông bao gồm Bacillus thuringiensis (Bt), một loại vi khuẩn hình thành bào tử sản xuất ra các protein kêu. Khi côn trùng ăn những cây bông này, các protein tiếng kêu liên kết với các tế bào bên trong côn trùng, làm rối loạn dòng chảy của kali qua côn trùng, cuối cùng giết chết nó. Bông bt được sản xuất bởi Monsanto và được trồng ở Ấn Độ.
Họ vi khuẩn Bt chứa 200 protein có hại cho nhiều loại côn trùng, đặc biệt là bọ cánh cứng, ấu trùng bướm, sâu đục quả bông, ruồi và ấu trùng bướm đêm. Ở những vùng mà những loài gây hại này là mối đe dọa chính đối với bông, việc sử dụng bông Bt làm giảm nhu cầu sử dụng thuốc trừ sâu phổ rộng trên cây trồng. Tuy nhiên, Bt không có hiệu quả đối với các loài gây hại khác, bao gồm cả rệp và bọ xít. Ở một số khu vực của Trung Quốc, việc sử dụng thuốc trừ sâu đã được tăng lên mức trước Bt trên ruộng bông vì nhu cầu chống lại những loài gây hại kháng Bt này.Tại Hoa Kỳ, việc sử dụng bông Bt mang lại năng suất cao hơn khoảng 5% trên mỗi mẫu Anh so với bông tiêu chuẩn từ năm 1996 đến 1998.
Bông bt đang được sử dụng rộng rãi ở Ấn Độ, quốc gia sản xuất lớn thứ hai trên thế giới. Tuy nhiên, vì hạt giống bông Bt của Monsanto đắt và không tồn tại lâu qua một thế hệ, các nhà nông nghiệp Ấn Độ đã phát triển giống của riêng họ có hạt có thể tái sử dụng. Mặc dù việc sử dụng bông Bt đang gây tranh cãi ở Ấn Độ, nhưng 83% bông của nước này đến từ loại bông này tính đến năm 2012.
