Mewtwo được coi là "trùm" cuối cùng của Pokémon FireRed và do đó, có rất ít diễn biến nội dung có cấu trúc sau khi bắt và /hoặc đánh bại Mewtwo.
Tuy nhiên, điều này không có nghĩa là trò chơi kết thúc. Bạn có thể bắt đầu huấn luyện EV của mình nếu bạn muốn chiến đấu cạnh tranh với những người chơi khác. Bạn cũng có thể tìm cách hoàn thành Pokédex của mình, nhưng điều đó có thể chứng minh là không thể nếu không có Gameshark hoặc thiết bị gian lận khác. Nếu tình cờ có thiết bị gian lận, bạn có thể khám phá Quần đảo Sevil để biết thêm một chút cốt truyện cũng như một vài trận chiến khác với Pokémon huyền thoại.
