Chất nhuộm màu tải được sử dụng trong quá trình điện di DNA để giúp các nhà khoa học xác định các đoạn nucleic của DNA. Hai loại thuốc nhuộm có màu sắc khác nhau chiết xuất axit nucleic trong điện trường. Các mẫu nặng hơn đi xuống phía dưới, trong khi các đoạn DNA nhẹ hơn sẽ nổi lên trên.
Hai kích thước tải thuốc nhuộm khác nhau sẽ tách các đoạn DNA nhỏ khỏi các đoạn lớn hơn. Điện di chuyển các hạt mang điện của thuốc nhuộm qua một lớp gel dày. Môi trường dày hơn này ngăn không cho DNA trôi đi trong mẫu. Khi chịu một điện trường, các đoạn DNA nhỏ hơn di chuyển đến điện cực nhanh hơn. Các mảnh dài hơn vẫn ở gần điểm khởi đầu của gel.
Thuốc nhuộm có hai màu khác nhau và chứa đầy các hạt mang điện. Các sắc thái phổ biến nhất được sử dụng là xanh lam và cam. Khi điện được áp dụng cho các loại thuốc nhuộm này, các kỹ thuật viên có thể theo dõi tiến trình tách chiết DNA. Việc nạp thuốc nhuộm được áp dụng với số lượng nhỏ trong ống nghiệm ở nhiệt độ phòng.
Nhận dạng DNA là rất quan trọng đối với một số kỹ thuật y tế và pháp y hiện đại. Các bác sĩ có thể xác định chính xác các bất thường di truyền trong chuỗi DNA của con người. Các nhà khoa học pháp y có thể xác định tội phạm nhờ các kỹ thuật thu thập bằng chứng công nghệ cao tại hiện trường vụ án. Các nhà sinh vật học có thể xác định cách hành động tốt nhất để cứu các dạng sống khác nhau khi các vật liệu di truyền xác định được các bệnh lý ở thực vật và động vật.
