Để bắt Deoxys trong Phiên bản Pokemon SoulSilver, người chơi phải chuyển Deoxys đến Pal Park từ Phiên bản Ruby, Sapphire hoặc Emerald. Cách duy nhất để đưa Deoxys vào Pal Park là sử dụng một trò chơi đã lưu hiện có và chuyển Pokemon vào Pal Park bằng cách sử dụng khe GameBoy Advance trên Nintendo DS.
Để bắt Deoxys trong Phiên bản HeartGold hoặc SoulSilver, trước tiên người chơi phải bắt được Deoxys ở Phiên bản Ruby, Sapphire hoặc Emerald. Giỏ trò chơi GameBoy Advance với trò chơi đã lưu trên đó phải được lắp vào khe GBA trên Nintendo DS hoặc DSLite. Sau đó, phiên bản HeartGold hoặc SoulSilver sẽ được đưa vào khe giỏ hàng của DS và trò chơi sẽ được bắt đầu.
Theo Bulbapedia, cách duy nhất để bắt Deoxys là chạm trán anh ta ở Pal Park. Chỉ có thể đến được Pal Park khi sử dụng HM03 (Surf). Ngay cả sau khi người chơi đến Pal Park, họ sẽ không thể vào đó cho đến khi họ đã điền toàn bộ Sinnoh Pokedex và nhận được National Pokedex.
Sau khi sở hữu National Pokedex, người chơi phải đến công viên và nói chuyện với Giáo sư Oak trên Đường 221. Tùy chọn "Di cư từ" sẽ được chọn trên màn hình menu chính và sau đó sẽ có cơ hội để chọn Pokemon để nhập từ trò chơi GameBoy Advance. Khi Deoxys được chọn, nó sẽ được thả vào tự nhiên.
Sau khi thả Deoxys vào Pal Park, người chơi chỉ cần đi lang thang trong khu vực cho đến khi gặp nó. Nắm bắt được nó là một quá trình đơn giản vì Quả bóng Park đặc biệt có tỷ lệ bắt bóng 100%.
Điều quan trọng cần lưu ý là sau khi chuyển Deoxys ra khỏi trò chơi GameBoy Advance, nó sẽ không thể truy cập được trên giỏ hàng đó nữa.